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    Clontech現貨 單細胞擴增試劑盒

    簡要描述:Clontech現貨 單細胞擴增試劑盒
    TAKARA授權代理 現貨 單細胞起始量全基因組擴增試劑盒,歡迎咨詢華雅干細胞!Clontech現貨

    • 產品型號:R300718
    • 廠商性質:代理商
    • 更新時間:2025-02-18
    • 訪  問  量:1747
    詳細介紹
    品牌TaKaRa供貨周期現貨
    應用領域醫療衛生,生物產業

    Clontech現貨 單細胞擴增試劑盒

    產品名稱: PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3    產品貨號:R300718 

     
     
    PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
    · 單細胞(或<15 pg DNA)起始,可獲得可重復的結果
    · 等位基因再現性
    · 易于使用和自動化
    · 應用廣泛,可以用于微陣列,PCR等
     
    PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以從單細胞擴增DNA,獲得高度可重復的文庫。細胞裂解和預擴增后,進行低背景的PCR擴增,并在3小時內獲得微克級產物。
    除了延續之前PicoPLEX WGA Kit可進行高度可重復的拷貝數變異(CNV)分析外,該試劑盒通過使用高保真酶,盡可能減少擴增誤差,并能檢測單核苷酸變異(SNV)。
     

     

     
     
     
    圖1. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV檢測
     
    以來自不同細胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的單細胞起始,使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3擴增基因組。之后取1ng的擴增產物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在Illumina MiSeq(PE 75)進行測序。對Fastq文件去除接頭序列信息后,與human genome assembly GRCh37進行比對。只分析常染色體。對于這兩個panels,校準歸一化至100萬reads,使用bedtools 2.25.0計算每1 Mb的 bin的reads數。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)繪制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3還顯示了可以高品質的進行染色體異倍性分析。
     
    圖2. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因組覆蓋范圍的重現性高
     
    以GM12878的單細胞樣本起始(一式兩份),分別使用PicoPLEX WGA v3,A公司試劑盒和B公司試劑盒擴增基因組。之后取1ng的擴增產物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在MiSeq(PE 75)進行測序。然后與human genome assembly GRCh37進行比對,歸一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后,使用bedtools 2.25.0計算每個1 Mb的bin的reads數。對這兩個單細胞文庫的每個窗口的total read進行繪制,計算Pearson和Spearman相關性并在每個圖中標明。
    Panel A. 包含異常值的樣本。*由于不同技術存在不同的偏差,沒有排除相關點,所以圖表的比例不同。
    Panel B. 排除異常值的樣本。與A公司和B公司試劑盒相比,PicoPLEX WGA v3具有更高的重現性和覆蓋度。

    Clontech現貨 單細胞擴增試劑盒

     

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