• 服務熱線

    15021010459
    產品中心
    當前位置:主頁 > 產品中心 > 核酸分析 > 文庫構建 >循環腫瘤細胞CNV文庫構建試劑盒,Rubicon

    循環腫瘤細胞CNV文庫構建試劑盒,Rubicon

    簡要描述:循環腫瘤細胞CNV文庫構建試劑盒,Rubicon:
    TAKARA旗下Rubicon公司PicoPLEX™DNA-seq試劑盒旨在擴增單細胞基因組DNA,以便在Illumina®新一代測序(NGS)平臺上可靠檢測染色體非整倍體和拷貝數變異(CNV)。可應用于包括使用卵裂球和滋養外胚層細胞的植入前基因篩查(PGS)和需要單細胞擴增的循環腫瘤細胞(CTC)中的CNV檢測。

    • 產品型號:Rubicon R300381
    • 廠商性質:代理商
    • 更新時間:2025-02-13
    • 訪  問  量:2186
    詳細介紹
    品牌其他品牌供貨周期一個月

     

    PicoPLEX™DNA-seq試劑盒使用技術,單管三步法3小時內完成單細胞擴增。

    PicoPLEX™DNA-seq試劑盒旨在擴增單細胞基因組DNA,以便在Illumina®新一代測序(NGS)平臺上可靠檢測染色體非整倍體和拷貝數變異(CNV)。可應用于包括使用卵裂球和滋養外胚層細胞的植入前基因篩查(PGS)和需要單細胞擴增的循環腫瘤細胞(CTC)中的CNV檢測。

     

    PicoPLEX DNA-seq Kit

    適用Illumina®NGS平臺的單細胞文庫制備

    Single Cell Library Preparation for Illumina® NGS Platforms

     

    英文名稱:PicoPLEX DNA-seq Kit

    中文名稱:PicoPLEX DNA-seq單細胞文庫制備試劑盒

    用途:單細胞DNA擴增制備illumina文庫,用于植入前遺傳診斷和循環腫瘤細胞檢測。

    成功實例:PicoPLEX DNA-seq試劑盒已成功處理單卵裂球,滋養外胚層細胞和培養細胞。

     PicoPLEX DNA-seq試劑盒可為單一細胞提供穩定且可重現的DNA擴增,用于有限的測序覆蓋度分析,不適用于高覆蓋率的深度測序,如從頭測序和/或全基因組測序。

    測序平臺:PicoPLEX庫推薦的測序平臺是Illumina MiSeq系統和HiSeq 2000/2500。要在Illumina NextSeq測序儀上使用,請在庫準備之前技術咨詢。

     PicoPLEX®技術 - 曾用于微陣列(arrays)法的單細胞拷貝數變異檢測,現在有單管形式可在Illumina NGS平臺上使用。 PicoPLEX WGA(單細胞全基因組擴增)長期以來一直被*的IVF診所用于植入前基因篩查和診斷,以檢測染色體非整倍體和拷貝數變異。

    PicoPLEX DNA-seq試劑盒簡化了文庫制備,整個過程在單個試管或單孔內進行,減少了錯誤和污染,加快了時間,并降低了成本。PicoPLEX DNA-seq試劑盒包含48份反應,包含將48份單細胞或DNA(6 pg至60 pg)轉換為illumina NGS文庫所需的一切,包括雙端索引(illumina indexes,放在一次性使用的微孔板中)。

     

    Rubicon Picoplex試劑訂購信息

    48次反應,包含一次性使用96孔板的48個雙端illumina indexes。

     

    品牌

    貨號/新貨號

    產品描述

    包裝

    Rubicon

    RB3050/R30050

    PicoPLEX WGA Kit,array CGH、PCR分析用

    50Rxns

    Rubicon

    RB3381/R300381

    PicoPLEX DNA-seq Kit,48種雙端illumina indexes

    48Rxns

     

    PicoPLEX DNA-seq試劑盒受美國8,206,913和歐盟待決申請的保護,僅供研究使用。

     

    歡迎您致電 重慶市華雅干細胞技術有限公司   

     

    Rubicon公司成立于2000年,總部位于美國密歇根州。產品都擁有技術,檢控嚴格,擁有cGMP級生產能力,有多個OEM合作伙伴,是單細胞測序文庫構建的。2017年1月,Rubicon 成為Takara的一員,并且發展良好。

     

    單細胞一代測序簡介

    新一代測序(NGS)能夠對許多應用進行精確和無偏差的基因組分析,包括檢測染色體非整倍性,拷貝數變異(CNV)插入和缺失。這些檢測尤其適用IVF診所胚胎植入前基因篩查(PGS)和癌癥遺傳學

    所有這些應用的起始材料由于使用單細胞而受到限制,并且需要基因組的可重復擴增作為NGS下游分析的先決條件。 PicoPLEX DNA-seq試劑盒專為滿足這種不斷增長的需求而開發,可幫助從單個細胞制備Illumina兼容NGS文庫。

    PicoPLEX DNA-seq文庫用于表征*的基因組特征,包括體外受精(IVF)診所PGS診斷所需染色體非整倍體異常和拷貝數變異檢測,以及癌癥研究的單腫瘤細胞(如CTC)

     

    PicoPLEX DNA-seq 優點

    減少ambiguity高度可重復的CNV和非整倍體檢測

    減少工作流程:三步完成從單細胞測序即用文庫的制備

    降低成本:單個試劑盒包含測序文庫制備所需一切

    減少污染和錯誤:文庫制備孔中完成,不需要轉移

    縮短結果時間:Illumina NGS文庫在不到3個小時制備好

     

    循環腫瘤細胞CNV文庫構建試劑盒,Rubicon

    Highly Reproducible CNV Detection Over the Entire GenomeAmplified libraries from 11 individual flow-sorted H929 cells were sequenced on an Illumina MiSeq® and downsampled to 250,000 total reads. Thirty-five base single-end reads were mapped to human over the entire genome.

    染色體1中高度可重復的CNV檢測:每個單獨的H929細胞中(參見上圖),如粉紅色或藍色條所示,在染色體1中*檢測到22Mb丟失和30Mb增加。

     

    PicoPLEX DNA-seq Kit試劑盒參數

     樣本

    上樣量:該試劑盒每次反應可容納5μL加樣量(細胞和緩沖液zui高2.5μL)。如果細胞在1x PBS中,則不要超過2.5μL的PBS。

    適用樣本:1-10個哺乳動物細胞(例如卵裂球,極體,滋養層細胞,羊膜細胞,CTC,培養細胞);分離的DNA(6 pg - 60 pg人類DNA);超過50 pg加樣量是可能的,但需要在步驟6和10處優化;分選的染色體。

    樣本采集兼容方法:流式分選(不要固定),稀釋和顯微操作與PicoPLEX DNA-seq兼容。

    細胞洗滌:建議在PBS(不含鈣,鎂和BSA)中洗滌并限制洗滌緩沖液低于2.5μL。

     

    反應時間

    PicoPLEX DNA-seq試劑盒可在<3小時內裂解細胞并準備好含indexes的NGS適用文庫。

     

    運輸和存儲PicoPLEX DNA-seq試劑盒(目錄號R300381)在干冰上運輸。試劑盒應在抵達后保存在-20°C。

     質量控制PicoPLEX DNA-seq Kit使用新一代測序(NGS)對應規格進行測試,以確保產品質量和*性。

     安全信息遵循標準的實驗室安全程序并穿戴合適的實驗服,防護眼鏡和一次性手套以確保人身安全并減少樣品制備和后續擴增反應過程中潛在的交叉污染。更多信息請參閱相應MSDS。

     

    原理和工作流程

    PicoPLEX DNA-seq原理圖

    PicoPLEX DNA-seq基于Rubicon Genomics的PicoPLEX技術,用于單細胞基因組DNA(gDNA)擴增,該技術使用多重循環的隨機引物進行可重復文庫構建。 PicoPLEX DNA-seq Kit遵循PicoPLEX WGA Kit的相同三步工作流程,包括細胞裂解,預擴增和zui終擴增。首先,特制配方裂解細胞并打斷DNA。接著,專門設計的隨機引物通過對產物進行zui小限度的擴增來選擇性地預擴增DNA,以產生高度可重現的文庫。zui后,用包含Illumina雙重條形碼的引物進行PCR擴增得到測序就緒文庫。

     

     

     

    組份

     

     

    組份

    顏色

    Cell Extraction Buffer細胞提取緩沖液

    綠色

    Extraction Enzyme Dilution Buffer

    提取酶稀釋緩沖液

    紫色

    Cell Extraction Enzyme

    細胞提取酶

    黃色

    Pre-Amp Buffer 預擴增緩沖液

    紅色

    Pre-Amp Enzyme 預擴增酶

    白色

    Amplification Buffer 擴增緩沖液

    桔色

    Amplification Enzyme  擴增酶

    藍色

    Nuclease-Free Water 無核酸酶水

    透明

    Dual Index Plate 雙端index 微孔板

     

    Quick Protocol 快速使用手冊

     

     

    循環腫瘤細胞CNV文庫構建試劑盒,Rubicon

    性能

    免除文庫定量:

    流式分選所得unsynchronized H929細胞擴增后,以恒定體積pooling,并且加載到MiSeq v3流通池上。由于PicoPLEX DNA-seq反應產生高度可重復的產物,所以pooling之前無需對文庫進行定量。圖中空白柱子部位表示該孔不含細胞。

     

     

    PicoPLEX DNA-seq試劑盒提供的染色體非整倍體檢測與arrays(陣列)分析*:通過使用相同的單胚胎細胞文庫進行陣列和NGS檢測,PicoPLEX DNA-seq試劑盒與24sure™陣列(Illumina)等效。文庫以48個兼容的條形碼pooling,并在2x100 MiSeq v2 PE中進行測序。

    測序結果與陣列結果*,測序顯示2p(如圖)的末端增益和12q末端丟失(數據未顯示),這與通過高分辨率FISH分析確認的親本DNA中未檢測到的易位*。(數據由GIVF提供)。

     

    PicoPLEX DNA-Seq Kit引用文獻

    • New protocol based on massive parallel sequencing for aneuploidy screening of preimplantation human embryos

    • Vendrell et al. 2017 Systems Biology in Reproductive Medicine, DOI: 10.1080/19396368.2017.1312633

    • Construction of thousands of single cell genome sequencing libraries using combinatorial indexing

    • Vitak et al. bioRxiv Jul. 23, 2016; doi: http://dx.doi.org/10.1101/065482.

    • A linkage map for the Newt Notophthalmus viridescens: Insights in vertebrate genome and chromosome evolution

    • Keinath et al. 2014 Developmental Biology

     

     

    ThruPLEX系列產品

     

    試劑盒

    應用

    特點

    樣本

    ThruPLEX® DNA-seq Kit

    通用DNA擴增試劑盒。應用范圍廣。文獻常見應用:ChIP-Seq。

    有多種illumina index選擇。

    50pg-50ng

    gDNA、cDNA、FFPE DNA、ChIP DNA

    ThruPLEX® Plasma-seq

    循環腫瘤細胞或其他疾病無創檢測,母體血漿中胎兒游離DNA分析

    優化用于血漿游離DNA(短又變性的DNA片段)。

     

    血漿、尿液、液體活檢1ng-30ng cfDNA

    ThruPLEX®Tag-seq Kit

    腫瘤或其他疾病中稀有變異等位基因檢測。

    莖環形接頭包含了分子標簽連接DNA片段兩端。

     

    1ng-50ng

    gDNA、cfDNA、FFPE DNA

     

    Rubicon公司成立于2000年,總部位于美國密歇根州。產品都擁有技術,檢控嚴格,擁有cGMP級生產能力,有多個OEM合作伙伴,是單細胞測序文庫構建的。2017年1月,Rubicon 成為Takara的一員,并且發展良好。

     

     

    Rubicon 試劑訂購信息

     

    品牌

    貨號

    新貨號

    產品描述

    包裝

    Rubicon

    RB4406

    R400406

    ThruPLEX DNA-seq 48D Kit

    ThruPLEX通用文庫構建試劑盒

    48Rxns

    Rubicon

    RB4407

    R400407

    ThruPLEX DNA-seq 96D Kit

    ThruPLEX通用文庫構建試劑盒

    96Rxns

    Rubicon

    RB4427

    R400427

    ThruPLEX DNA-seq 48S Kit

    ThruPLEX通用文庫構建試劑盒

    48Rxns

    Rubicon

    RB4428

    R400428

    ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit

    ThruPLEX通用文庫構建試劑盒

    48Rxns

    Rubicon

    RB4523

    R400523

    ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit

    ThruPLEX通用文庫構建試劑盒

    12Rxns

    Rubicon

    RB4490

    R400490

    ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

    ThruPLEX血漿測序試劑盒

    12Rxns

    Rubicon

    RB4491

    R400491

    ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit

    ThruPLEX血漿測序試劑盒

    48Rxns

    Rubicon

    RB4492

    R400492

    ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit

    ThruPLEX血漿測序試劑盒

    96Rxns

    Rubicon

    RB4584

    R400584

    ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit

    12Rxns

    Rubicon

    RB4585

    R400585

    SMARTer® ThruPLEX® Tag-seq 48S Kit

    48Rxns

    Rubicon

    RB4586

    R400586

    SMARTer® ThruPLEX® Tag-seq 96D Kit

    96Rxns

    Rubicon

    RB3050

    R30050

    PicoPLEX WGA Kit,array CGH、PCR分析用

    50Rxns

    Rubicon

    RB3381

    R300381

    PicoPLEX DNA-seq Kit,48種雙端illumina indexes

    48Rxns

     

    及更多Rubicon文庫構建試劑盒

    歡迎您致電 重慶市華雅干細胞技術有限公司   

     

     


    產品咨詢

    留言框

    • 產品:

    • 您的單位:

    • 您的姓名:

    • 聯系電話:

    • 常用郵箱:

    • 省份:

    • 詳細地址:

    • 補充說明:

    • 驗證碼:

      請輸入計算結果(填寫阿拉伯數字),如:三加四=7
    推薦產品

    2025 版權所有 © 重慶市華雅干細胞技術有限公司  備案號:渝ICP備14000349號-4 sitemap.xml 管理登陸 技術支持:化工儀器網

    地址:重慶市江北區金渝大道153號8棟20-14 傳真:023-63419626 郵件:sales@ys-bio.com

    重慶市華雅干細胞技術有限公司主要經營干細胞研究 干細胞治療產品 生物試劑 實驗耗材 藥物研發等產品。

    關注我們

    服務熱線

    400-021-2200

    掃一掃,關注我們

    主站蜘蛛池模板: 久久99热狠狠色精品一区| 久久精品中文字幕久久| 国产精品99久久精品| 国亚洲欧美日韩精品| 国产精品成人va| 亚洲精品视频免费观看| 2020最新久久久视精品爱| 亚洲欧美精品综合中文字幕| 91精品国产自产在线观看| 四虎国产精品永久在线| 精品视频在线观看你懂的一区| 国产99视频精品免费专区| 日本国产精品久久| 91精品国产高清久久久久久国产嫩草 | 国产精品偷伦视频免费观看了| 国产精品伦一区二区三级视频| 欧美日韩成人精品久久久免费看| 亚洲日本精品一区二区| 国产精品嫩草影院AV| 亚洲精品成人网站在线观看| 久久精品国产国产精品四凭| 亚洲午夜精品一区二区| 国产日韩精品在线| 国产精品视频一区二区三区无码| 亚洲无线观看国产精品| 麻豆精品视频在线观看| 久久国产精品免费| 国产精品白丝AV嫩草影院| 精品久久香蕉国产线看观看亚洲| 久久精品人成免费| 亚洲中文久久精品无码ww16 | 91精品视频网站| 精品一区二区三区波多野结衣| 中文精品99久久国产| 色哟哟国产精品免费观看| 久久免费99精品国产自在现线| 国产精品制服丝袜亚洲欧美| 97久久精品人人做人人爽| 99久久精品国产综合一区| 91po国产在线精品免费观看| 欧美精品国产一区二区|